Domov O inštitutu Telefonski imenik

David Dobnik

Delovno mesto: mladi raziskovalec na enovitem doktorskem študiju
Telefon: 05 923 28 19
Oddelek: Oddelek za biotehnologijo in sistemsko biologijo

Izobrazba:


  • 2002-2007 Študij biologije na Biotehniški fakulteti Univerze v Ljubljani

  • od 2007 - Podiplomski študij bioloških in biotehniških znanosti - smer biotehnologija na  Biotehniški fakulteti Univerze v Ljubljani. Od začetka podiplomskega študija sem kot mladi raziskovalec zaposlen na Nacionalnem inštitutu za biologijo.

Raziskovalno delo:


Mentorica: prof. dr. Jana Žel, somentorica: izr. prof. dr. Kristina Gruden

  • Ob začetku sem se pridružil skupini za detekcijo gensko spremenjenih organizmov, kjer sem se vključil v evropski projekt Co-Extra. Sodeloval sem pri razvoju nove metode za določanje gensko spremenjenih organizmov. Članka na to temo sta bila objavljena v revijah Nucleid Acid Research in Analytical and Bioanalytical Chemistry.

NAIMA: target amplification strategy allowing quantitative on-chip detection of GMOs
NAIMA as a solution for future GMO diagnostics challenges

  • Drugi, večji del mojih raziskav, predstavlja preučevanje vloge različnih genov, ki sodelujejo v interakciji med krompirjem in njegovim patogenom, virusom PVY. Vlogo izbranih genov bomo ovrednotili s pomočjo transgenih rastlin, v katerih bomo spremenili izražanje izbranih genov ter nato spremljali odziv teh rastlin ob okužbi z virusom.
V reviji Življenje in tehnika sem objavil poljudni članek o tem, kako nastane gensko spremenjena rastlina.

Regeneracija rastlin po transformaciji z Agrobacterium tumefaciens:

regeneracija rastlin


Vse pridobljene transgene linije krompirjev vzdržujemo in množimo v tkivnih kulturah (leva slika). Fiziološke poskuse, kjer rastline okužimo z virusom, pa izvajamo na rastlinah posajenih v zemlji (desna slika):




Poleg spremljanja poteka okužbe v rastlinah s spremenjenim izražanjem genov, nas zanima tudi lokalizacija proteinov, ki so produkt izbranih genov. Hkrati pa želimo spremljati še delovanje promotorjev izbranih genov. Oboje nam omogočajo fluorescentni reporterski proteini.

Lokalizacijo proteinov spremljamo s pomočjo zelenega fluorescentnega proteina (GFP):



Aktivnost promotorja izbranega gena se kaže kot prisotnost zelenega fluorescentnega proteina  v citoplazmi celic:





V reviji Življenje in tehnika sem na temo fluorescentnih proteinov objavil članek z naslovom Osvetljevanje notranjosti organizmov.


Fotogalerija:

















Izpis bibliografije (COBISS)