Vabilo na predavanje dr. Anže ŽUPANIČ: »Dodana vrednost sistemske biologije: dva primera novih odkritij okoljsko pomembnih molekularnih mehanizmov pri zelenih algah«, 7.11.2017

20 okt
Vabilo na predavanje dr. Anže ŽUPANIČ: »Dodana vrednost sistemske biologije: dva primera novih odkritij okoljsko pomembnih molekularnih mehanizmov pri zelenih algah«, 7.11.2017

Submit to FacebookSubmit to Google PlusSubmit to TwitterSubmit to LinkedInNatisni

Nacionalni inštitut za biologijo Vas vabi, da se udeležite predavanja:

»Dodana vrednost sistemske biologije: dva primera novih odkritij okoljsko pomembnih molekularnih mehanizmov pri zelenih algah«,


ki ga bo predstavil dr. Anže ŽUPANIČ

Predavanje bo potekalo v torek 7. novembra 2017, ob 15.00,
v Biološkem središču, Večna pot 111, v Ljubljani, v predavalnici B3.

Povzetek predavanja:

Zelene alge so eden izmed ključnih komponent večine vodnih in mnogih kopenskih ekosistemov. Čeprav je kot njihova glavna vloga v ekosistemih poznana predvsem primarna produkcija, igrajo pomembno vlogo tudi v biogeokemiji mikrohranil in so med najbolj občutljivimi bioindikatorji vodnega onesnaženja; v obeh primerih odgovorni molekularni mehanizmi niso dobro poznani. V seminarju bom predstavil dve študiji, v katerih smo z uporabo sistemsko-biološkega pristopa našli nove molekularne mehanizme. V prvi smo izmerili dinamiko speciacije mikrohranila selena in preizkusili njeno ujemanje z družino matematičnih modelov speciacije. Čeprav je bilo mogoče do nekaterih zaključkov priti zgolj z interpretacijo eksperimentalnih rezultatov, je uporaba matematičnega modela na več ravneh ključno doprinesla k študiji: omogočila je ločevanje med dvema konkurenčnima intrepretacijama (neposredno ali preko načrtovanja dodatnih eksperimentov), oceno parametrov posameznih kemičnih reakcij in ekstrapolacijo rezultatov na različne okoljske pogoje. V drugi študiji smo na podlagi javno dostopnih podatkov o genski ekspresiji izgradili ko-ekspresijsko mrežo, ki smo jo uporabili za napovedovanje funkcij genov odgovornih za občutljivost ali toleranco alge na srebrove ione. Nekatere napovedi smo potrdili z uporabo linij alg z ustreznimi mutacijami. S študijo smo pokazali, da je v nekaterih primerih mogoče napovedati funkcijo genov na osnovi obstoječega znanja in javno dostopnih podatkov, četudi so bili ti pridobljeni za odgovarjanje na povsem druga znanstvena vprašanja.

Predstavitev bo potekala v slovenskem jeziku.

Vljudno vabljeni!


Dodatne informacije: prof. dr. Kristina Gruden, kristina.gruden@nib.si, 059 232 824.