23
nov
Bioinformatske metode v transkriptomiki
Čeprav so bili v zadnjem času objavljeni številni algoritmi in postopki za analizo podatkov mikromrež in je jasno, da lahko izbira analize znatno vpliva na rezultat, trenutno ni konsenza, katera metoda bi bila najboljša. Uporabljene metode je zato potrebno prilagoditi tako zasnovi poskusa kot tudi eksperimentalnemu sistemu. Prav tako je zaradi velike količine podatkov, ki jih z metodami mikromrež dobimo, analiza in predvsem biološka interpretacija podatkov težavna. Orodja za vizualizacijo izražanja genov v okviru procesov in metabolnih poti, v katerih ti geni sodelujejo, lahko bistveno pripomorejo k interpretaciji podatkov.
V predavanju bodo predstavljene izbrane metode za obdelavo podatkov mikromrež in vizualizacijo rezultatov. Podani bodo rezultati študije časovnega izražanja genov krompirja po okužbi z virusom.