NIB

Invazivne tujerodne vrste (INNS) ogrožajo biotsko raznovrstnost, dobro počutje ljudi in svetovno gospodarstvo ter prispevajo k degradacijiekosistemov in poslabšanju ekosistemskih storitev po vsem svetu. Razumevanje dejavnikov, ki olajšajo prilagajanje INNS in uspešnost njihovihinvazij, je bistveno za ublažitev njihovih vplivov. Nedavne študije so poudarile pomembno vlogo mikrobnih skupnosti povezanih z gostitelji, pribioloških invazijah (z mikrobi posredovane invazije). Zlasti virom (del mikrobioma, ki ga sestavljajo virusi) INNS je večinoma neraziskan, čeprav sovirusi najštevilčnejši patogeni mikrobi v okolju in imajo lahko izrazite učinke na uspešnost invazije INNS. V tem projektu bomo analizirali konceptemikrobno posredovane invazije pri eni najuspešnejših skupin vodnih invazivnih vrst, sladkovodnih rakih. Za dosego tega cilja bomo v projektu Weavesodelovale tri odlične raziskovalne skupine s strokovnjaki s področja ekologije, biologije rakov in virologije, iz vrhunskih institucij v posameznihpartnerskih državah: Matematično-prirodoslovne fakultete Univerze v Zagrebu (PMF) iz Hrvaške (z visokim strokovnim znanjem in izkušnjami napodročju ekologije, biologije rakov in imunologije), Nacionalni inštitut za biologijo (NIB) iz Slovenije (priznani strokovnjaki za raziskave viromov)inUniverza Južne Češke v Čeških Budejovicah (FFPW) iz Češke (visoko strokovno znanje o ekologiji rakov, njihovi biologiji in distribuciji).Razširilibomo omejeno znanje o virusih rakov z obsežno karakterizacijo viroma pri treh uspešnih in razširjenih invazivnih rakih v EU: signalnemu raku,trnavcuin marmornatemu škarjarju. Z uporabo najsodobnejših metagenomskih pristopov bomo identificirali znane in nove viruse, ki so prisotni v večkot 10populacijah izbranih invazivnih rakov, ter analizirali njihovo distribucijo in povezanost z izvornimi vzorci s počjo podatkovnega rudarjenja zuporabonajsodobnejših orodij in baz podatkov za odkrivanje virusnih zaporedij. Nadalje bomo primerjali virome rakov med vrstami in v različnihekološkihkontekstih (primerjava med izvornem in območjem invazije, primerjava različnih zgodovin vnosa, populacij različnih starosti, številčnosti, inpopulacijs prisotnimi sorodnimi domorodnimi vrstami rakov), da bi pojasnili njihove učinke na sestavo in raznolikost viroma. Nazadnje bomo izvedliobsežnoštudijo prenosa, da bi preučili morebiten pojav homogenizacije viroma pri stikih med vrstami in njene osnovne mehanizme. Preučili bomotudi učinkeintrinzičnih lastnosti rakov, povezanih z zdravstvenim stanjem (preko ocene imunskega odziva, organosomatskega indeksa in analizami

SICRIS

Povezava do projekta