Projekti

Vloga neoantigenov pri nedrobnoceličnem raku pljuč

Koordinator projekta: asist. dr. Julij Šelb, dr. med., spec., Univerzitetna klinika za pljučne bolezni in alergijo Golnik

Koordinator za NIB: za NIB: dr. Anže Smole

Oznaka: J3-4516

Trajanje: 1.10.2022 - 30.9.2025

Raziskovalni project J3-4516 financira Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije iz državnega proračuna.

Učinkovito protitumorsko imunost pri ljudeh je v veliki meri mogoče pripisati T-celicam, usmerjenim proti neoantigenom, ki so prisotni na tumorskih celicah. Neoantigeni so skupina proteinov, ki so vezani na HLA molekule in nastanejo zaradi tumorsko specifičnih mutacij. Ker zaobidejo centralno timično toleranco imajo visok imunogeni potencial . Zato predstavljajo dobro tarčo za protitumorsko imunost. Pljučni rak je med najpogostejšimi in daleč najbolj smrtonosnimi vrstami raka. Ker je kajenje glavni dejavnik tveganja za razvoj pljučnega raka, je skupaj z drugimi vrstami raka, ki so izpostavljeni veliki obremenitvi s kancerogeni, tudi med najbolj s somatskimi mutacijami (in verjetno tudi neoantigeni) obremenjenimi tipi rakov. Koncept neoantigenov se uspešno uporablja pri rutinski obravnavi pljučnega in drugih rakov, predvsem pri zdravljenju teh bolnikov z zaviralci kontrolnih točk imunskega odziva (ZKTIO). Nedavno je FDA odobrila zdravljenje z ZKTIO pembrolizumabom pri posameznikih z napredovalimi tumorji, ki imajo visoko tumorsko mutacijsko breme (TMB; ≥10 mutacij/megabazo). TMB predstavlja posredno metodo ocene neoantigenskega bremena, vendar je veliko manj specifična, saj ocena TMB ne upošteva vseh bioloških korakov, potrebnih za predstavitev mutiranega zaporedja DNK kot neoantigena imunskemu sistemu. ZKTIO delujejo samo na podskupino bolnikov; v splošni kohorti bolnikov z nedrobnoceličnim pljučnim rakom (NDRP) se le približno 20 % posameznikov odzove na zdravljenje. Ker imajo ZKTIO veliko neželenih učinkov (po nekaterih ocenah ima do 60 % bolnikov na ZKTIO neželene učinke) in so tudi draga zdravila, je zato izrednega pomena, da zdravljenje prejmejo le tisti, ki se bodo na zdravljenje odzvali. Vendar pa nimamo učinkovitih biomarkerjev, ki bi napovedali odziv na zdravljenje. Do danes sta bila samo zgoraj omenjeno TMB in imunohistokemična (IHK) ekspresija PD-L1 v tumorskem tkivu odobrena kot klinična označevalca za vodenje terapije z ZKTIO. Različni multiparametrični modeli napovedi (ki upoštevajo več spremenljivk tako tumorja kot gostitelja) redno kažejo izboljšano napovedovanje odziva na zdravljenje z ZKTIO v primerjavi s samo-TMB/samo-PD-L1 IHK. Dosledno je bil v teh modelih najpomembnejši napovedi dejavnik TMB. V skladu z biološkim sklepanjem je nedavna študija pokazala, da je obremenitev z neoantigeni (mutacije, ki se predstavijo in jih prepozna imunski sistem) boljši napovedni dejavnik odziva na zdravljenje z ZKTIO kot TMB. Vendar, po nam dostopnih podatkih, nobena skupina še ni uporabila neoantigenske obremenitve kot napovednega dejavnika v multiparametričnem modelu napovedovanja odziva na zdravljenje z ZKTIO. Domnevamo, da bo uporaba neoantigenske obremenitve v takem kontekstu bistveno izboljšala natančnost napovedi takšnega modela; to bo tudi osrednja hipoteza sedanjega projekta. Zato v projektu načrtujemo vzpostavitev algoritmov za napovedovanje neoantigenov, vi-vitro validacijo rezultatov teh algoritmov in uporabo teh rezultatov (t.i. obremenitev z neoantigeni) za izboljšanje modelov napovedovanja odziva na zdravljenje z ZKTIO. Poleg tega bomo ocenili umestitev celotnega koncepta uporabe z neoantigeni izboljšanega postopka napovedovanja odziva na zdravljenje z ZKTIO v lokalno rutinsko klinično prakso, da bi ugotovili, ali imajo lahko bolniki in lokalni zdravstveni sistem koristi od tega. Menimo, da bo sodelovanje Univerzitetne Klinike za Respiratorne in Alergijske Bolezni Golnik , glavne ustanove v Sloveniji in pomembne ustanove za diagnostiko in zdravljenje pljučnega raka v jugovzhodni Evropi ter skupine za Imunologijo in Celično Imunoterapijo pri Nacionalnem Inštitutu za Biologijo - pod vodstvom dr. Anžeta Smoleta in dr. Jelke Pohar kot nalašč za izvedbo tako zapletenega projekta z obsežnimi in daljnosežnimi posledicami v bazični in klinični raziskovalni stroki.

Sestava projektne skupine – SICRIS

Bibliografski podatki in ostali podatki o projektu – SICRIS

Obseg akreditacije Nacionalnega inštituta za biologijo je naveden v Prilogi k akreditacijski listini in Seznamu akreditiranih metod

Nacionalni referenčni laboratorij za
določanje GSO v hrani in krmi

Nacionalni etalon za področje množina snovi/bioanalize
nukleinskih kislin, zlasti na področju GSO in mikroorganizmov

Javno pooblastilo za opravljanje
nalog zdravstvenega varsta rastlin

Scroll

Projekti

Vloga neoantigenov pri nedrobnoceličnem raku pljuč

Hitre povezave

Oddelki in raziskave

Storitve in produkti