Ana Rotter

dr. ANA ROTTER

znanstvena sodelavka

Telefon:

+386 (0)5 9232 940

Elektronski naslov:

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.

Področje raziskav:

Biostatistika

Analiza omrežij

Zasnova poskusov in analiza ekoloških podatkov


   

 

KRATEK ŽIVLJENJEPIS

 

od marca 2014: podoktorska raziskovalka na Morski biološki postaji. Področje raziskav: statistika – časovne vrste, analiza omrežij

 

od junij 2011: postdoktorska raziskovalka na Oddelku za biotehnologijo in sistemsko biologijo. Področje raziskav: sistemska biologija, statistika, analiza omrežij, bioinformatika.

 

od 2005 – maj 2011: mladi raziskovalec na področju statistike na Nacionalnem inštitutu za biologijo, oddelek za biotehnologijo in sistemsko biologijo. Doktorska disertacija: „Razvoj in implementacija orodij sistemske biologije: primer analize podatkov v rastlinski fiziologiji”. Mentorica prof. dr. Kristina Gruden, somentor prof. dr. Andrej Blejec.

 

od 2004 - Univerza v Ljubljani, Univerzitetni podiplomski študij statistike

 

2004-2005 – zaposlena v podjetju Delamaris d.d., kjer sem delala v skupini za kontrolo kakovosti izdelkov, kasneje pa tudi v službi za okolje in higieno. V sklopu tega sem izvajala in uvajala okoljska testiranja, spremljala delovanje čistilne naprave ter urejala okoljska poročila in zakonsko zahtevane monitoringe.

 

1996 - 2002 - Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, interdisciplinarni študij Mikrobiologije . Diplomska naloga: „Toksinotipizacija sevov Clostridium difficile iz različnih držav“. Opazovali smo, ali se v različnih državah pojavljajo različni toksinotipi Clostridium difficile ter kateri toksinotipi prevladujejo v določenih državah. Ugotavljali smo tudi prisotnost binarnega toksina pri različnih vzorcih. Datum zagovora: 10.10.2002, mentorica prof. dr. Maja Rupnik

 

1992 - 1996 - Gimnazija Koper

 

Rojena 24.4.78

 

 

 

SODELOVANJA

 

Björn Usadel, Max Planck Golm, Nemčija. Sodelovanje je potekalo leta 2005 na področju uporabe bioinformatike pri genski ontologiji rastlin Cornelis J. (Ron) van Noorden, AMC (Academisch Medisch Centrum) Amsterdan, Nizozemska na področju biološke interpretacije rezultatov statistične obdelave – primer iz onkologije. Sodelovanje poteka od 2011 do danes.

 

Zanimivosti:

Leta 2011 sem dobila nacionalno nagrado L'Oreal »za ženske v znanosti«
Sem sindikalna zaupnica sindikata SVIZ-NIB, v katerega je vključenih približno 40 % zaposlenih na inštitutu.

 

 

VKLJUČENOST V PROJEKTE

 

ARRS projekti:

 

 

 

EU projekti

 

Cytothreat: Usoda in učinki ostankov citostatskih zdravil v okolju

 

januar 2011 – januar 2015

 

 

BALMAS: Sistem ravnanja z balastnimi vodami za varstvo Jadranskega morja.

 

november 2013 – marec 2016

 

 

COST mrežne akcije: genderSTE: spol v znanosti, tehnologiji ter okolju (http://www.genderste.eu/)

 

november 2012 – november 2016

 

 

 

 

 

PODROČJE RAZISKAV

 

- biostatistika: zasnova poskusov, obdelava poskusov, svetovanje, bioinformatika, analiza omrežij, podatkovne baze, transkriptomika, MapMan

 

- Želim si spoznati in v praksi uporabiti čimveč klasičnih statističnih metod. Tukaj uporabljam predvsem programsko okolje R, tako zaradi svoje široke uporabnosti na področju statistike kot zaradi privlačnih vizualnih izrisov, ki jih uporabnik lahko naredi. Zanima me sistemska biologija. Moja velika ambicija je izpopolniti se v analizi omrežij za biološke podatke

 

- v zadnajem času se spoznavam s stanjem na področju enakopravnosti spolov v znanosti. Pogosto se v praksi izkaže, da za ženske obstajajo t.i. »lepljiva tla« in »stekleni stropi«, ki nam, v primerjavi z moškimi kolegi, onemogočajo enakopravno vzpenjanje po karierni poti. Želim si osveščati sodelavke in sodelavce o nepravičnem stanju.

 

 

 

   

 

DRUGE AKTIVNOSTI

 

- ocenjevalec za revije Bioinformatics, BMC Bioinformatics, OMICS, Plant Physiology

 

 

 

 

IZBRANE (NOVEJŠE) PUBLIKACIJE

 

Članki: 

 

1. RAMŠAK, Živa, BAEBLER, Špela, ROTTER, Ana, KORBAR, Matej, MOZETIČ, Igor, USADEL, Björn, GRUDEN, Kristina. GoMapMan : integration, consolidation and visualization of plant gene annotations within the MapMan ontology.Nucleic acids research, ISSN 0305-1048, 2014, 9 str, [in press], doi: 10.1093/nar/gkt1056. [COBISS.SI-ID 2966607

2. PETEK, Marko, ROTTER, Ana, KOGOVŠEK, Polona, BAEBLER, Špela, MITHÖFER, Axel, GRUDEN, Kristina. Potato Virus Y infection hinders potato defence response and renders plants more vulnerable to Colorado potato beetle attack. Molecular ecology, ISSN 0962-1083, 2014, vol. , no. , 34 str., [in press], doi: 10.1111/mec.12932. [COBISS.SI-ID 3215695]

3. ŠMID, Ida, ROTTER, Ana, GRUDEN, Kristina, BRZIN, Jože, BUH GAŠPARIČ, Meti, KOS, Janko, ŽEL, Jana, SABOTIČ, Jerica. Clitocypin, a fungal cysteine protease inhibitor, exerts its insecticidal effect on Colorado potato beetle larvae by inhibiting their digestive cysteine proteases. Pesticide biochemistry and physiology, ISSN 0048-3575, [in press] 2014, 21 str., doi: 10.1016/j.pestbp.2014.12.022. [COBISS.SI-ID 28231719]

 

 

 Povezava na COBISS