Raziskave in ekspertize

 

Raziskave:

 

- Raziskave ekologije, strukture in funkcije planktonskih združb, predvsem fitoplanktona, ter njihovih sprememb zaradi podnebnih sprememb in drugih antropogenih pritiskovv

- Vloga fitoplanktona pri kroženju hranil in ponoru ogljika v obalnih morskih ekosistemih

- Ekologija škodljivih cvetenj alg (HAB)

- Razumevanje funkcionalne ekologije fitoplanktonskih vrst na podlagi njihovih funkcionalnih lastnosti

- Raziskave diverzitete fitoplanktonskih, predvsem diatomejskih, virusov ter vpliva virusnih okužb na kroženje snovi

- Raziskave genetskih lastnosti ekološko pomembnih vrst, vključno s HAB, in razvoj novih metod v okoljski diagnostiki

- Vzdrževanje dolgoročne serije bioloških in kemičnih podatkov

- Preučevanje dolgoročnih sprememb in trendov planktonskih združb s statističnimi analizami in modeliranjemi

- Razvoj metod za oceno ekološkega stanja morja na podlagi fitoplanktona

 

Ekspertize:

 

- Integrativna taksonomija fitoplanktona (svetlobna in elektronska mikroskopija, filogenetsko črtno kodiranje posameznih sevov, metabarkodiranje fitoplanktonskih združb)

- Določanje strukture in delovanja fitoplanktonskih združb z uporabo metod, neodvisnih od gojenja mikroorganizmov, naslednje generacije sekvenciranja ter najsodobnejših orodij bioinformatike in računalniške biologije

- Gojenje, taksonomska identifikacija ter raziskovanje fiziologije in biokemije izbranih sevov mikroalg iz zbirke kultur na MBP

- Metode klasične virologije in metagenomska analiza virusne združbe

- Meritve primarne produkcije z uporabo radioaktivno označenih spojin (¹⁴C)

- Kemotaksonomija (HPLC analiza pigmentov)

- Vrstična elektronska mikroskopija – SEM (biološki vzorci)

- Določanje fitoplanktonskih toksinov s hitro imunoencimsko metodo (ELISA)

- Analize časovnih serij

 

 

Osebje

 

Izr. prof. dr. Patricija Mozetič, znanstvena svetnica, vodja DE

http://www.nib.si/mbp/sl/cv/patricija-mozetic

https://scholar.google.com/citations?user=0KzXa2gAAAAJ&hl=sl

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.

 

Dr. Vesna Flander-Putrle, višja strokovno-raziskovalna sodelavka

https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0001-8718-9819

https://scholar.google.com/citations?user=8vpGnJ4AAAAJ&hl=en&oi=ao

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.

 

Dr. Janja Francé, strokovno-raziskovalna svetnica, namestnica vodje DE

https://www.nib.si/mbp/sl/cv/janja-france

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.

 

Petra Slavinec, mlada raziskovalka

https://www.researchgate.net/profile/Petra-Slavinec-2

https://www.nib.si/mbp/sl/cv/petra-slavinec

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.

 

Dr. Timotej Turk Dermastia, znanstveni sodelavec

https://www.nib.si/mbp/sl/cv/timotej-turk-dermastia

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.

 

Slavica Nastić, strokovna sodelavka, tudi članica DE Infrastukturni center MBP

http://www.nib.si/mbp/sl/cv/slavica-nastic 

Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.  

 

 

Projekti: potekajoči in nedavno zaključeni

 

Raziskave obalnega morja – ARIS raziskovalni program P1-0237

1.1.2020-31.12.2027

Vodja: Patricija Mozetič

http://www.nib.si/eng/index.php/projects?view=project&id=166

 

Vpliv virusne okužbe na spremembe v fitoplanktonskih agregatih in njihovo mikrobno razgradnjo, ARIS J7-70251

1.3.2026-28.2.2029

Vodja: Timotej Turk Dermastia

https://projects.nib.si/diavir/

 

The science of Rhythms in our lives HORIZON-CSA

2026-2028

Koordinator za MBP: Vesna Flander Putrle

 

Priprava predloga metodologije in navodil za presojo vpliva posega na stanje morskih voda - raziskovalni projekt ciljnega raziskovalnega programa, CRP projekt V1-24035

1.10.2024-30.9.2026

Vodja: Vesna Flander Putrle

https://www.nib.si/projektinib?view=project&id=504

 

Vpliv podnebnih sprememb na začetek cvetenja fitoplanktona in posledice za dinamiko prehranjevalnega spleta: primerjava med severnim in južnim Jadranom - bilaterala Slovenija - Hrvaška v letih 2023 in 2024

1.4.2023-31.3.2025

Vodja: Patricija Mozetič

https://www.nib.si/projektinib?view=project&id=447

 

Diatomejski virusi in njihov vpliv na kroženje snovi (DIAVIR) – podoktorski projekt ARIS 01Z14396

1.10.2022-1.10.2024

Vodja: Timotej Turk Dermastia

https://projects.nib.si/diavir/

 

ABIOMMED - Support Coherent and Coordinated Assessment of Biodiversity and Measures Across Mediterranean for the Next 6-year Cycle of MSFD Implementation

2021-2023

Vodja delovnega sklopa Janja Francé

https://www.abiommed.eu/

 

MEDREGION - Support Mediterranean Member States towards the implementation of the Marine Strategy Framework Directive new GES Decision and programmes of measures and contribute to regional/subregional cooperation

2019-2021

https://medregion.eu/

 

Monitoring bioloških elementov kakovosti ekološkega stanja morja v skladu z veljavnimi metodologijami - letna pogodba

Agencija RS za okolje

Vodja: Janja Francé

https://www.arso.gov.si/vode/morje/

 

Monitoring toksičnega fitoplanktona na območjih gojišč užitne klapavice v Strunjanskem zalivu, Seči in na Debelem rtiču - letna pogodba

MKGP, Uprava RS za varno hrano, veterinarstvo in varstvo rastlin

Vodja: Patricija Mozetič

 

Sofinanciranje dejavnosti v okviru Nacionalnega odbora programa za Medvladno oceanografsko komisijo (IOC) – letna pogodba

MVZI, Urad za UNESCO

Vodja: Patricija Mozetič

 

 

Izbrane objave

 

2026

Montali, G., Neri, F., Banchi, E., Cerino, F., Turk Dermastia, T., Francé, J., Mozetič, P., et al. 2026. Phytoplankton diversity in the Northern Adriatic Sea : insights and inconsistencies from microscopy and metabarcoding. Biology. DOI: 10.3390/biology15060487.

 

Puc, U., Abina, A., Salvi, E., Malačič, V., Francé, J., Zanelli, R., Zidanšek, A. 2026. Development and field testing of a cavitation-based robotic platform for sustainable in-water hull cleaning. Journal of marine science and engineering. DOI: 10.3390/jmse14020227.

 

Slavinec, P., Francé, J., Fortič, A., Mozetič, P. 2026. Unveiling microalgal diversity in Slovenian transitional waters (Adriatic Sea): a first step toward ecological status assessment. Diversity. DOI: 10.3390/d18010021.

 

Ubaldi, M., Neri, F., Montali, G., Romagnoli, T., Tomasini, A., Cerino, F., Turk Dermastia, T., Mozetič, P., Fancé, J., Spoto, C., Accoroni, S., Totti, C. 2026. Microalgal communities in mucilage aggregates (Northern Adriatic Sea, summer 2024) based on microscopy and metabarcoding. Phycology. DOI: 10.3390/phycology6010005.

 

2025

Mager, S., Manfellotto, F., Ruggiero, A., Di Tuccio, V., Cerino, F., Accoroni, S., Nishimura, T., Mikhno, M., Fattorini, N., Turk Dermastia, T., et al. Genomic diversity in time and space in the toxic diatom Pseudo-nitzschia multistriata. Harmful algae. DOI: 10.1016/j.hal.2024.102791.

 

Turk Dermastia, T., Francé, J., Arapov, J., Neri, F., Accoroni, S., Totti, C., Cerino, F., Ferrante, M.I., Bernardi Aubry, F., Finotto, S., Godrijan, J., Drakulović, D., Mozetič, P. 2025. Comprehensive Insights into Pseudo-nitzschia Research in the Adriatic Sea: Diverse Perspectives and Emerging Discoveries.Estuar. Coast. Shelf Sci. DOI: 10.1016/j.ecss.2025.109283.

 

2024

Buchan, P.M., Glithero, L.D., Mckinley, E., Strand, M., Champion, G., Flander-Putrle, V., et al. 2024. A transdisciplinary co-conceptualisation of marine identity. People and nature. DOI: 10.1002/pan3.10715.

 

Giani, M., Pavlidou, A., Kralj, M., Varkitzi, J., Borja, Á., Menchaca, I., Lipizer, M., Partescano, E., Urbini, L., Francé, J., et al. 2024. Assessment of the eutrophication status at Mediterranean sub-basin scale, within the European Marine Strategy Framework Directive. Science of the total environment. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2024.173876.

 

Henigman, U., Mozetič, P., Francé, J., Knific, T., Grebenc, S., Dolenc, J., Kirbiš, A., Biasizzo, M. 2024. Okadaic acid as a major problem for the seafood safety (Mytilus galloprovincialis) and the dynamics of toxic phytoplankton in the Slovenian coastal sea (Gulf of Trieste, Adriatic Sea). Harmful algae. DOI: 10.1016/j.hal.2024.102632.

 

Marzidovšek, M., Francé, J., Podpečan, V., Grebenc, S., Dolenc, J., Mozetič, P. 2024. Explainable machine learning for predicting diarrhetic shellfish poisoning events in the Adriatic Sea using long-term monitoring data. Harmful algae. DOI: 10.1016/j.hal.2024.102728.

 

Turk Dermastia, T., Kutnjak, D., Gutiérrez-Aguirre, I., Brussaard, C. P. D., Bačnik, K. 2024. Discovery of novel and known viruses associated with toxigenic and non-toxigenic bloom forming diatoms from the Northern Adriatic Sea. Harmful algae. DOI: 10.1016/j.hal.2024.102737.

 

Vascotto, I., Bernardi Aubry, F., Bastianini, M., Mozetič, P., Finotto, S., Francé, J. 2024. Exploring the mesoscale connectivity of phytoplankton periodic assemblages' succession in northern Adriatic pelagic habitats. Science of the total environment. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2023.169814.

 

Vascotto, I., Mozetič, P., Francé, J. 2024. Phytoplankton morphological traits and biomass outline community dynamics in a coastal ecosystem (Gulf of Trieste, Adriatic Sea). Community ecology: an official organ of the Hungarian Ecological Society. DOI: 10.1007/s42974-024-00215-4.

 

2023

Turk Dermastia, T., Vascotto, I., Francé, J., Stanković, D., Mozetič, P., 2023. Evaluation of the rbcL marker for metabarcoding of marine diatoms and inference of population structure of selected genera. Front. Microbiol. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1071379

 

2022

Flander-Putrle, V., Francé, J., Mozetič, P. 2022. Phytoplankton Pigments Reveal Size Structure and Interannual Variability of the Coastal Phytoplankton Community (Adriatic Sea). Water. DOI: 10.3390/w14010023

 

Turk Dermastia, T., Dall’Ara, S., Dolenc, J., Mozetič, P. 2022. Toxicity of the Diatom Genus Pseudo-nitzschia (Bacillariophyceae) : insights from toxicity tests and genetic screening in the Northern Adriatic Sea.Toxins. DOI: 10.3390/toxins14010060.

 

2021

Brush, M.J., Mozetič, P., Francé, J., Bernardi Aubry, F., Djakovac, T., Faganeli, J., Harris, L.A., Niesen, M. 2021. Phytoplankton dynamics in a changing environment. In: Malone, T.C., Malej, A., Faganeli, J. (eds.). Coastal ecosystems in transition: a comparative analysis of the northern Adriatic and Chesapeake Bay, (Geophysical monograph series). AGU: Wiley. DOI: 10.1002/9781119543626.ch4.

 

Francé, J., Varkitzi, I., Stanca, E., Cozzoli, F., Skejić, S., Ungaro, N., Vascotto, I., Mozetič, P., Ninčević Gladan, Ž., Assimakopoulou, G., Pavlidou, A., Zervoudaki, S., Pagou, K., Basset, A., 2021. Large-scale testing of phytoplankton diversity indices for environmental assessment in Mediterranean sub-regions (Adriatic, Ionian and Aegean Seas). Ecological Indicators. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107630.

 

Zingone, A., Escalera, L., Aligizaki, K., Fernandez-Tejedor, M., Ismael, A., Montresor, M., Mozetič, P., Taş, S., Totti, C. 2021. Toxic marine microalgae and noxious blooms in the Mediterranean Sea: a contribution to the Global HAB status report. Harmful algae. DOI: 10.1016/j.hal.2020.101843.

 

 

 

Sodelovanja 

 

Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta https://www.uni-lj.si/university/

Institut “Jožef Stefan” https://ijs.si/ijsw

Kemijski inštitut  https://www.ki.si/

Nacionalni veterinarski inštitut https://www.vf.uni-lj.si/nvi

Inštitut za vode RS https://www.izvrs.si/

OGS https://www.ogs.trieste.it/

ISMAR http://www.ismar.cnr.it/

CMR Rovinj https://www.irb.hr/eng/Divisions/Center-for-Marine-Research

Univerza v Zagrebu http://www.unizg.hr/homepage/

Institut za oceanografiju i ribarstvo (IOR), Split, Hrvaška, https://galijula.izor.hr/

Institute for Marine and Coastal Research, University of Dubrovnik, Croatia https://www.imp-du.com/en

Fondazione Centro Ricerche Marine – Laboratoro Nazionale di riferimento per le Biotossine Marine, Cesenatico, Italy https://www.centroricerchemarine.it/it-IT/index-index/

Microbia Environnement https://www.microbia-environnement.com/

Hellenic Centre for Marine Research (HCMR), Grčija, https://www.hcmr.gr/

Univerza v Salentu, Lecce, Italija https://www.unisalento.it/

Università Politecnica delle Marche, Italija https://www.univpm.it/Entra/

Agenzia regionale per la protezione dell'ambiente del Friuli Venezia Giulia (ARPA FVG), Italija https://www.arpa.fvg.it/

IRB zagreb https://www.irb.hr/eng/

ICM-CSIC Barcelona https://icmdivulga.icm.csic.es/

Rutgers University, USA https://marine.rutgers.edu/

NIOZ https://www.nioz.nl/en

 

 

Druge aktivnosti

 

Izobraževanje in ozaveščanje:

 

Člani DE sodelujejo v pedagoškem procesu na:

- Univerzi na Primorskem (Fakulteta za matematiko, naravoslovje in informacijske tehnologije, Pedagoška fakulteta)

- Univerzi v Ljubljani (Interdisciplinarni doktorski študijski program Varstvo okolja)

- Mednarodni podiplomski šoli Jožefa Stefana (MPŠ)

 

Zavzemamo se za razvoj človeških virov ne le prek programa za mlade raziskovalce, temveč tudi kot mentorji domačim in tujim študentom na obveznih praksah ter pri vodenju diplomskih in magistrskih nalog. Z rednimi dejavnostmi ozaveščanja (npr. Dan odprtih vrat MBP, Noč raziskovalcev) in drugimi oblikami širjenja znanja prispevamo k dvigu oceanske pismenosti družbe.

 

Nacionalna imenovanja in članstva v strokovnih skupinah:

 

- Nacionalna predstavnica v Medvladnem panelu za škodljiva cvetenja alg (IOC-FAP IPHAB) (P. Mozetič)

- Predsednica Nacionalnega odbora Medvladne oceanografske komisije (NO IOC) pri Slovenski nacionalni komisiji za UNESCO (P. Mozetič)

- Podpredsednica in tajnica Nacionalnega odbora za Desetletje oceanov pri Slovenski nacionalni komisiji za UNESCO (P. Mozetič, V. Flander Putrle)

- Nacionalna predstavnica za Desetletje oceanov (V. Flander Putrle)

- Članica delovne skupine SPA-RAC za pelagični habitat v podporo Barcelonski konvenciji (J. Francé)

- Predstavnica v medresorskem delovnem telesu za akvakulturo na MKGP (V. Flander Putrle)

- Predsednik Prirodoslovnega društva Slovenije (T. Turk Dermastia)

 

Nagrade, priznanja, štipendije:

 

- FEMS štipendija, ICM-CSIC Barcelona, Španija, 2025 (P. Slavinec)

- Euromarine OYSTER ECR Cooperation project “Diversity and Responses of Plankton: Tracking Microbial Community Structure in the Mediterranean Sea – from Satellite to DNA (DROPTHEMIC-MED)”, 2025 (P. Slavinec)

- Znanstveni dosežek ARIS »Odlični v znanosti 2024« na področju biotehnike za članek 10.1016/j.hal.2024.102632, nastal v sodelovanju z Veterinarsko fakulteto (P. Mozetič, J. Francé)

- Podoktorska Fulbright štipendija za projekt »Assessing virus infection of Pseudo-nitzschia and its impact on carbon cycling across different oceanic regimes«, Rutgers University, ZDA, 2024 (T. Turk Dermastia)

- Nagrada »Prometej znanosti za odličnost v znanosti in komunikaciji 2018« mlademu raziskovalcu (T. Turk Dermastia)

 

 

Galerija

 

 

Na slikah (od leve proti desni in od zgoraj navzdol):

 

1. Vzorčenje s fitoplanktonsko mrežico (Foto Vesna Flander Putrle)

2. Filtracija (Foto Vesna Flander Putrle)       

3. Delo na invertnem svetlobnem mikroskopu

4. Izobraževanje za SEM (Foto Milijan Šiško)

5. Delo na SEM (Foto Jena Jamšek)

6. Diatomeja Actinocyclus sp. (SEM) (Foto Petra Slavinec)

7. Kokolitoforid Helicosphaera carteri (SEM) (Foto Petra Slavinec)

8. Detajl Helicosphaere carteri (SEM) (Foto Petra Slavinec)