Tematski dnevi za šole
TEMATSKI DNEVI ZA ŠOLE
Spoštovani,
Na Morski biološki postaji Piran Nacionalnega inštituta za biologijo smo pripravili tematske dneve o morju, primerne predvsem za srednješolce, a so dobrodošle tudi druge starostne skupine. Vsak tematski dan, s pričetkom ob 9.00, vključuje dve predavanji, delavnice, ogled potapljaške baze in v primeru ugodnih vremenskih razmer še vožnjo s čolnom do oceanografske boje ali do marikulture (ribogojnice ali školjčišče). Predviden zaključek je ob 13.30.
Tri tematske dneve bomo izvedli v mesecu aprilu in tri v mesecu oktobru 2024.
Izbirate lahko med:
1. Onesnažila in tokovi v morju: od kod, kako in kam (8. 4. 2024) a. Ali je naše morje res onesnaženo? (delavnica 1) b. Morski tokovi in podnebne spremembe. (delavnica 2) |
2. Pestrost in ekologija morskih mikroorganizmov (12. 4. 2024) a. Zakaj in kako preučevati fitoplankton (delavnica 1) b. Skrivno življenje morskih bakterij (delavnica 2) |
3. Biodiverziteta in ogroženost pridnenih organizmov (10. 4. 2024) a. Pestrost morskih travnikov in gozdičkov (delavnica 1) b. Pestrost bentoških nevretenčarjev in rib (delavnica 2) |
4. Morske biotehnologije in cilji trajnostnega razvoja Združenih narodov (18. 4. 2024) a. Algea rast in mini bar (delavnica 1) b. Resne igre: kaj veste o ciljih trajnostnega razvoja ZN (delavnica 2) |
Oktobrski termini 2024 bodo objavljeni naknadno.
Cena programa je 28,00 EUR z DDV na posameznega dijaka, pri minimalni udeležbi 10 dijakov. Največje možno število dijakov je 44.
Za več informacij se obrnite na g. Tadeja Gračnerja (Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate.). Za sodelovanje na tematskih dnevih Morske biološke postaje Piran se morate predhodno prijaviti na naslov Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate., saj je število mest omejeno.
V pričakovanju vašega obiska vas lepo pozdravljamo.
Sodelavci Morske biološke postaje Piran (NIB)
aktualno (test)
aktualno (test)
Katalog patogenih in škodljivih mikrobov
V okviru projekta ARRS (Agencije za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije) »Dejavniki, ki strukturirajo mikrobiom obalnega morja s poudarkom na patogenih – celostni pristop« (J1-9157) (vodja izr. prof. dr. Valentina Turk) smo pripravili seznam potencialno patogenih in škodljivih bakterijskih izolatov ter fitoplanktonskih vrst, določenih v slovenskem morju (Tržaški zaliv, severni Jadran) z uporabo molekularnih in klasičnih taksonomskih in gojitvenih metod.
Fitoplankton smo vzorčili po celotnem vodnem stolpcu, t.i. integriran vzorec, bodisi z uporabo fitoplanktonske mreže z očesi velikosti 20 μm bodisi s cevjo premera 3 cm. Vzorci so bili fiksirani z nevtraliziranim 4 % formaldehidom in do pregleda shranjeni v temnih steklenicah.
Fitoplanktonske organizme, ki povzročajo škodljiva cvetenja alg (Harmful Algal Blooms – HAB), smo določili s pomočjo invertnega fluorescentnega mikroskopa (ZEISS Axio Observer Z1) z digitalno kamero (AxioCam Mrc5) in vrstičnega elektronskega mikroskopa (TESCAN MIRA). Nekateri osebki so bili obarvani z barvilom Calcofluor white M2R, kar je omogočilo boljši ogled ploščic celične stene - teke dinoflagelatov, katerih razporeditev je pomemben taksonomski znak. Za identifikacijo vrst diatomejskega rodu Pseudo-nitzschia so bile uporabljene genetske metode in transmisijska elektronska mikroskopija na izolatih sevov določenih vrst (metode podrobno opisane v članku Turk Dermastia et al., 2020 https://doi.org/10.1016/j.hal.2020.101773). Sekvence ribosomalne DNA (28S, ITS) in kloroplastnega genetskega označevalca rbcL so deponirane v podatkovni bazi GenBank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/).
V katalogu je opisanih 32 taksonov, ki povzročajo škodljiva cvetenja alg; od tega je 24 vrst dinoflagelatov (75 %), 7 vrst diatomej (22 %) in ena vrsta silikoflagelatov (3 %). Večina teh vrst, kar 69 %, je toksičnih in lahko povzročajo zastrupitve z morsko hrano.
Bakterije so bile izolirane iz vzorcev morske odvzete na postaji 00BF (Boja Vida) (45° 32’ 55, 68” N, 13°33’ 1,89” E), na globini 5 m z Niskinovim vzorčevalnikom, z mesečno frekvenco od februarja 2010 do marca 2012. Vzorce morske vode smo inokulirali na gojišče za morske bakterije (ZoBell). Določili smo morfološke lastnosti izbranih izoliranih kolonij, ekstrahirali DNA za analize sekvenciranja ter določen volumen izoliranih in taksonomsko določenih izolatov shranili v tekočem gojišču na nizki temperaturi (30 % glicerol, temperatura -80 °C) za pripravo zbirke bakterijskih kultur, ki jo hranimo in vzdržujemo na NIB-MBP.
16S rRNA genske sekvence so deponirane v podatkovni bazi GenBank (NCBI - National Centre for Biotechnology Information https://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Arhivirani so tudi vsi fizikalni in kemični podatki morske vode v času vzorčenja.
Zbirka bakterijskih izolatov vključuje 1131 sevov, ki so razvrščeni v domeno Bakterije. Prevladujejo bakterijski sevi Proteobacteria (86,4 %, od tega 47,8 % Alphaproteobacteria in 38,6 % Gammaproteobacteria), Actinobacteria (11,5 %), Bacteriodetes (1,3 %) in Cytophagia (0,1 %).
Shema izolacije in identifikacije posamezne bakterijske kolonije
Opis morfoloških lastnosti kolonij nekaterih bakterijskih izolatov
Fotografski posnetki kolonij zraslih na gojišču
- Seznam bakterijskih izolatov
Fizikalna oceanografija
Title of unit/ Ime DE |
Physical oceanography / Fizikalna oceanografija |
Fields of research and expertise / Raziskave in ekspertize |
Research: - research of water mass and sediment dynamics in coastal seas using high resolution numerical models - numerical forecasting of water mass and sediment dynamics in coastal seas - analysis of measured oceanographic data and results of numerical models using statistical and machine learning methods Expertise: - numerical modelling of water mass and sediment dynamics with high resolution numerical models, applied for planning of mariculture, deposition of dredged sediments in navigable waterways, outfalls and dilution of sewage and storm water runoffs - acquisition, quality control and cleaning of oceanographic measurement data - application of statistical and machine learning methods to oceanographic measurements and numerical modelling results in forecast of sea-surface elevation - analysis of time series of oceanographic data in estimates of climatic trends of sea-surface elevation, temperature and salinity - providing measurement data and metadata to various international infrastructures that allow users to access this data |
� |
Unit photo / Fotografija enote |
� |
Staff members/Osebje |
Prof. dr. Vlado Malačič https://www.nib.si/mbp/sl/cv/vlado-malacic Ta e-poštni naslov je zaščiten proti smetenju. Za ogled potrebujete Javascript, da si jo ogledate. |
Dr. Matja� Ličer |
Dr. Boris Petelin |
Dr. Branko Čermelj |
Dr. Martin Vodopivec |
Borut Umer, PhD student |
Projects / Projekti |
Coastal Sea Research � ARRS Research Programme P1-0237 1.1.2020-31.12.2025 http://www.nib.si/eng/index.php/projects?view=project&id=166 |
Erosion in Coastal Seas and Navigable Rivers - ARRS Research Project J2-9444 1.9.2018 - 31.08.2021 |
Developing a sustainable model for the growth of the "green port" - ARRS Research Project L7-1847 1.7.2019 - 30.06.2022 |
MED OSMOSIS - Mediterranean governance for Strategic Maritime Surveillance and Safety issues 01. 11. 2019 - 30. 06. 2022 |
GreenHull � Green technologies for ecological cleaning of the biological incrustation on hulls in the Northern Adriatic Sea 01.03.2020 � 31.5.2022 |
Sharemed � Sharing and enhancing capabilities to address environmental threads in Mediterranean Sea (new HF radar for measurements of sea-surface currents over the Guls of Trieste 105,000 �). 01.10.2019 � 30.06.2022 |
SMS - Sensing toxicants in Marine waters makes Sense using biosensors (FP7-OCEAN) 1.8.2013 � 31.8.2017 |
SeaDataCloud: Further developing the pan-European infrastructure for marine and ocean data management - H2020-INFRAIA-2016-2017 https://www.seadatanet.org/About-us/SeaDataCloud |
HarmoNIA � Harmonization and Networking for contaminant assessment in the Ionian and Adriatic Seas 1. 2. 2018 - 30. 11. 2019 |
EMODNET CHEMISTRY 3 � DG MARE 1.5.2017�30.4.2019 |
����� EMODNET DATA INGESTION � DG MARE ����� 1.5.2017�30.4.2019 ����� https://www.emodnet-ingestion.eu/
|
Publications / Objave Up to 10 most relevant publications should be chosen.[m3] |
�UST, Lojze, FETTICH, Anja, KRISTAN, Matej, LIČER, Matja�. HIDRA 1.0 : deep-learning-based ensemble sea level forecasting in the northern Adriatic. Geoscientific model development. Apr. 2021, ISSN 1991-959X, vol. 14, no. 4, str. 2057-2074. https://gmd.copernicus.org/articles/14/2057/2021/, DOI: 10.5194/gmd-14-2057-2021.
QUERIN, Stefano, COSOLI, Simone, GERIN, Riccardo, LAURENT, C�lia, MALAČIČ, Vlado, PRISTOV, Neva, POULAIN, Pierre-Marie. Multi-platform, high-resolution study of a complex coastal system : the TOSCA experiment in the Gulf of Trieste. Journal of marine science and engineering, April 2021, ISSN 2077-1312, 2021, vol. 9, no. 5, str. 1-28. https://www.mdpi.com/2077-1312/9/5/469, DOI: 10.3390/jmse9050469.
RUBINO, Angelo, GAČIĆ, Miroslav, BENSI, Manuel, KOVACEVIC, Vedrana, MALAČIČ, Vlado, MENNA, Milena, NEGRETTI, Maria Eletta, SOMMERIA, Joel, ZANCHETTIN, Davide, BARRETO, Ricardo V., URSELLA, Laura, CARDIN, Vanessa, CIVITARESE, Giuseppe, ORLIĆ, Mirko, PETELIN, Boris, SIENA, Giuseppe. Experimental evidence of long-term oceanic circulation reversals without wind influence in the North Ionian Sea. Scientific reports. 2020, vol. 10, str. 1-9. ISSN 2045-2322. https://www.nature.com/articles/s41598-020-57862-6, DOI: 10.1038/s41598-020-57862-6. 5309519
BARTH, Alexander, ALVERA-AZC�RATE, Aida, LIČER, Matja�, BECKERS, Jean-Marie. DINCAE 1.0 : a convolutional neural network with error estimates to reconstruct sea surface temperature satellite observations. Geoscientific model development. 2020, vol. 13, iss. 3, str. 1609-1622, ilustr. ISSN 1991-959X. DOI: 10.5194/gmd-13-1609-2020.
LIČER, Matja�, ESTIVAL, Sol�ne, REYES-SUAREZ, Catalina, DEPONTE, Davide, FETTICH, Anja. Lagrangian modelling of a person lost at sea during the Adriatic scirocco storm of 29 October 2018. Natural hazards and earth system sciences. 2020, vol. 20, iss. 8, str. 2335-2349, ilustr. ISSN 1561-8633. DOI: 10.5194/nhess-20-2335-2020.
MALAČIČ, Vlado, �AGAR, Nedjeljka. Seawater icicles of the Adriatic Sea. Bulletin of the American Meteorological Society, vol. 100, no. 6, str. 987-994, ISSN 0003-0007, 2019. http://dx.doi.org/10.1175/BAMS-D-18-0118.1, DOI: 10.1175/BAMS-D-18-0118.1.
PETELIN, Boris, KONONENKO, Igor, MALAČIČ, Vlado, KUKAR, Matja�. Frequent subgraph mining in oceanographic multi-level directed graphs. International journal of geographical information science. 2019, vol. 33, no. 10, str. 1936-1959. ISSN 1365-8816. DOI: 10.1080/13658816.2019.1599124.
MALAČIČ, Vlado. Wind direction measurements on moored coastal buoys. Journal of atmospheric and oceanic technology, vol. 36, no. 7, str. 1401-1418, ISSN 0739-0572, 2019. https://journals.ametsoc.org/doi/10.1175/JTECH-D-18-0171.1, DOI: 10.1175/JTECH-D-18-0171.1.
GENOV, Tilen, ANGELINI, Valeria, HACE, Ana, PALMISANO, Giuseppe, PETELIN, Boris, MALAČIČ, Vlado, PARI, Sauro, MAZZARIOL, Sandro. Mid-distance re-sighting of a common bottlenose dolphin in the northern Adriatic Sea: insight into regional movement patterns. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom. 2016, letn. 96, �t. 4, str. 909-914, ilustr. ISSN 0025-3154. http://journals.cambridge.org/action/displayAbstract?fromPage=online&aid=10308967&fulltextType=RA&fileId=S0025315415001241, DOI: 10.1017/S0025315415001241.
|
Colaborations / Sodelovanja Organizations, institutions or individuals with who unit is working on regular basis |
OGS https://www.ogs.trieste.it/
LEGI Laboratoire des Ecoulements G�ophysiques et Industriels http://www.legi.grenoble-inp.fr/web/?lang=en
ARSO Slovenian Environment Agency http://www.arso.gov.si/en/
University of Ljubljana, Faculty of Civil and Geodetic Engineering https://www.en.fgg.uni-lj.si/
University of Ljubljana, Faculty of Maritime Studies and Transport https://www.fpp.uni-lj.si/en
University of Ljubljana, Faculty of Computer and Information Science https://www.fri.uni-lj.si/en
Javno podjetje OKOLJE Piran d.o.o. (Public Municipal Enterprize OKOLJE d.o.o.)
Javni zavod za spodbujanje podjetni�tva in razvojne projekte, Občina Izola (EUSAIR Facility Point, Community of Izola)
|
�. |
Other activities �/ Druge aktivnosti |
� |
Photos / Galerija |
� |
�
�